Первым деканом  факультета был назначен член-корреспондент АН СССР 
Владимир Владимирович Голубев (декан в 1933–1935 и в 1944–1952 гг.).

В разные годы деканами факультета были следующие ученые:

• профессор Лев Абрамович Тумаркин (1935–1939), 

• академик АН СССР Иван Георгиевич Петровский (1940–1944), 

• профессор Юрий Николаевич Работнов (1952–1954), 

• академик АН СССР Андрей Николаевич Колмогоров (1954 – 1958), 

• профессор Николай Алексеевич Слезкин (1958–1962), 

• профессор Нколай Владимирович Ефимов (1962–1968), 

• профессор Петр Матвеевич Огибалов (1968–1977), 

• член-корреспондент АН СССР Алексей Иванович Кострикин (1977–1980), 

• академик РАН Олег Борисович Лупанов (с 1980 г. по 2006 г.)

С 2006 г. по настоящее время обязанности декана факультета исполняет профессор Владимир Николаевич Чубариков.